Evolution of influenza A viruses in exhibition swine and transmission to humans, 2013–2015 18 Decemb

تکامل ویروس های آنفلوانزای A در خوک های نمایشگاهی و انتقال به انسان، 2013- 2015.................................................................
خوکی یک ظرف مخلوط کننده برای ظهور ویروس های جدید آنفلوانزا (A (IAV است. انتقال بین گونه ای IAV با منشاء خوکی، سلامت عمومی و خطر بیماری همه گیر را به همراه دارد. در ایالات متحده، اکثر رویدادهای انتقال IAV مشترک بین انسان و دام در ارتباط با قرار گرفتن در معرض خوک در نمایشگاه های کشاورزی رخ داده است. بر این اساس، این رابط انسان و حیوان نیازمند استراتژی‌های کاهشی است که با درک مکانیسم‌های انتقال بین گونه‌ای در خوک‌های نمایشگاهی آشنا می‌شوند. به همین ترتیب، تنوع IAV در خوکی می‌تواند منبعی برای ویروس‌های جدید یا جهش‌یافته باشد که هم برای خوک‌ها و هم سلامت انسان را به خطر می‌اندازد.
در تلاش برای درک بهتر این خطرات، در اینجا ما اپیدمیولوژی IAV را در خوکی های نمایشگاهی و انتقال متعاقب آن به انسان با انجام آنالیزهای فیلوژنتیکی با استفاده از توالی ژنوم کامل از 272 جدایه IAV جمع آوری شده از خوکی نمایشگاهی و 23 ویروس A(H3N2)v از انسان بررسی کردیم. میزبان در طول 2013-2015. شصت و هفت نمایشگاه (24.2٪) حداقل یک آزمایش خوک برای IAV مثبت با شیوع کلی تخمینی 8.9٪ داشتند (95٪ فاصله اطمینان (CI: 8.3-9.6، کلپر-پیرسون). از 19 ژنوتیپ موجود در خوک، 5 ژنوتیپ در انسان نیز شناسایی شد. بین تعداد موارد انسانی یک ژنوتیپ و شیوع آن در خوک های نمایشگاهی همبستگی مثبت وجود داشت. علاوه بر این، ما نشان دادیم که ویروس‌های A(H3N2)v به شدت با ویروس‌های خوکی نمایشگاهی که در همان سال شایع بودند، خوشه‌بندی شدند.
این داده‌ها نشان می‌دهد که ژنوتیپ‌های متعدد IAV از تبار خوکی انسان‌ها را آلوده کرده‌اند، و ژنوتیپ‌های بسیار شایع IAV در خوک‌های نمایشگاهی در طول یک سال معین نیز سویه‌هایی هستند که اغلب در موارد انسانی نوع IAV شناسایی می‌شوند. نظارت مستمر و شناسایی سریع IAVها در خوکی‌های نمایشگاهی می‌تواند ارزیابی فنوتیپی به موقع و تطبیق سویه‌های واکسن کاندید را با ویروس‌های موجود در رابط انسان و حیوان که به احتمال زیاد به انسان سرایت می‌کنند، تسهیل کند.